通過 "蛋白質(zhì)組學(xué)HLA配體組分析 "對呈現(xiàn)在HLA上的肽進(jìn)行全面分析

札幌醫(yī)科大學(xué)于9月28日宣布，它已經(jīng)發(fā)現(xiàn)一部分未翻譯的RNA被翻譯成片段并呈現(xiàn)在癌細(xì)胞表面，使其成為T淋巴細(xì)胞的目標(biāo)。 這項(xiàng)研究是由該大學(xué)病理一系的鳥越俊彥教授和金瀨孝之講師領(lǐng)導(dǎo)的研究小組進(jìn)行的。 該研究結(jié)果已發(fā)表在《癌癥免疫學(xué)研究》上。

已經(jīng)證明，當(dāng)被人類免疫細(xì)胞(細(xì)胞毒性T淋巴細(xì)胞)攻擊時(shí)，癌癥會(huì)消退。 新的癌癥藥物，即免疫檢查點(diǎn)抑制劑，就是基于這種機(jī)制。 然而，人們對哪些分子(抗原)被淋巴細(xì)胞識(shí)別以優(yōu)先攻擊癌細(xì)胞還不是很清楚。

該研究小組利用蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)來解決這個(gè)問題。 人類細(xì)胞轉(zhuǎn)錄了大量的非翻譯RNA，這些RNA被認(rèn)為是不制造蛋白質(zhì)的。 在這項(xiàng)研究中，我們專注于長的非翻譯RNAs，并測試了它們作為淋巴細(xì)胞靶點(diǎn)的潛力。 我們使用了一種名為 "蛋白質(zhì)基因組學(xué)HLA配體組分析 "的新技術(shù)，它將質(zhì)譜分析與下一代測序相結(jié)合。 傳統(tǒng)的蛋白質(zhì)組學(xué)只搜索數(shù)據(jù)庫中的已知蛋白質(zhì)序列，而蛋白質(zhì)基因組學(xué)是基于樣本基因信息，可以包括數(shù)據(jù)庫中沒有的序列。 HLA配體組分析是一種提取和全面測序細(xì)胞HLA上呈現(xiàn)的肽的新技術(shù)。

長的非翻譯RNA PVT1被翻譯成片段并呈現(xiàn)在癌細(xì)胞的表面。

對結(jié)直腸癌組織的分析顯示，片段翻譯發(fā)生于一種名為PPVT1的長非翻譯RNA，它呈現(xiàn)在癌細(xì)胞的表面。 PVT1是長非翻譯RNA之一，位于基因組中癌基因Myc的下游。 PVT1是基因組中最長的非翻譯RNA之一。

此外，在幾個(gè)結(jié)直腸癌患者的組織中檢測到了識(shí)別PVT1肽的CD8+T淋巴細(xì)胞，證實(shí)這些T淋巴細(xì)胞能準(zhǔn)確識(shí)別和攻擊癌細(xì)胞。

PVT1被認(rèn)為是一種致癌基因，在許多結(jié)直腸癌組織中表達(dá)。 鳥越教授和他的同事正在與制藥公司合作，開發(fā)用于治療結(jié)直腸癌的人工抗體和轉(zhuǎn)基因淋巴細(xì)胞。 Torigoe和他的同事們還在與制藥公司合作，開發(fā)用于治療結(jié)腸直腸癌的人工抗體和轉(zhuǎn)基因淋巴細(xì)胞。"我們還在利用新冠狀病毒疫苗中使用的mRNA疫苗技術(shù)開發(fā)預(yù)防癌癥的疫苗，"該小組說。